
近日,东莞医科师范大学首先其他的医院王学浩教授团队合作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向药物势能细胞代谢检测分析服务。
英语翻译文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
繁体中文宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
老客户计量单位:南京医科大学
钻研涂料:细胞
拜谱带来了产品:转录组测序+蛋白质互作组+靶向疗法激光能量分泌组
技术设备路线规划:
科研可是
01、YBX1被检验为HCC中糖酵解的重要的人类基因
本钻研数据文件库采集HCC良性良性良性恶性肿瘤样本量(n=7)的单上皮神经上皮细胞RNA测序数据文件库集来定性定量分析一下,会发现糖酵解吸附性最主要的一起在良性良性良性恶性肿瘤上皮神经上皮细胞中,hdWGCNA定性定量分析一下区分出9个染色体接口(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的繁衍定性定量分析一下判定YBX1为单独繁衍高风险主观因素(图1H)。进的一步通过IHC、WB试验和良性良性良性恶性肿瘤阻止与相临非良性良性良性恶性肿瘤阻止的区域转录组学数据文件库集印证YBX1是肝上皮神经上皮细胞癌冶疗的未知靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判别为的调节HCC细胞系糖酵解的根本原则
02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗电能分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1依照并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并使得YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷硝化作用,最终得以加快其核转位
进步加测YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是引响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC肿瘤内部中或用OGT治理和改善剂OSMI-1净化正确处理,YBX1球血清质横向取得有效降低,YBX1磷硝化作用取得避免(图4A-C)。IP研究凸显,在一致的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷硝化作用横向取得大于YBX1-T57A,显示磷硝化作用的增大一方面仅是担心比较高的YBX1球血清质表达爱出来(图4D)。分开了核和质混合物发觉TMG净化正确处理的HCC肿瘤内部中YBX1核表达爱出来的增大(图4E-F),进步发觉YBX1磷硝化作用的关键的控制分子是AKT(图4G-I)。这么多发觉突出O-GlcNAc糖基化顺利通过有利于加速其磷硝化作用来增加YBX1球血清质增强性并有利于加速核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现有助于于其进几步形成磷碱化体现并也能有助于其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1利于PKM2转录
06、YBX1 还可以延长组核蛋白乳过酸修饰语情况
研发出现YBX1敲低偏态大幅度降低膳食纤维质乳过酸,还是比较是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解克中药制剂2-DG的实践证明了糖酵解与组膳食纤维乳过酸的马上同步,克制糖酵解可偏态大幅度降低H3K18la质量(图6D)。PKM2过形容可逆转转YBX1敲低伴发的H3K18la骤降,到外源乳酸整理并不是改善H3K18la,还伴YBX1形容调整,提醒会存在正向着返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR证明,H3K18la实现含有于YBX1进行子马上增強其转录,该全过程受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),并出现P300 调整是YBX1增強H3K18乳酰化成用的规则(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳过酸突显品质
文章内容总结
在一项研发中报道范文了YBX1在HCC中高表述,那么与糖酵解密码切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,而使安稳核胆固醇并加剧其表述。这类装饰还有助于YBX1在T57处的磷酸性反应,有助于其核易位。那么,此全过程怎强了糖酵解一些什么是人类基因的转录并影响乳酸的产生。显然,YBX1激发P300的转录,继而控制组核蛋白质的乳酸性反应,特意是H3K18la,H3K18乳酸性反应正在向改善YBX1什么是人类基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传双面馈环考核机制图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向药物能量消耗代谢转化组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、译文资料后呈现组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅期刊论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.