草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿平台性最经常考的疾患中的一种。肾组织安排中CaOx硫化锌过饱和的堆积会会诱发肾小管上皮细胞磨损和凋亡，诱发会诱发肾结石的所产生。短链脂肪酸多酸由消化道内活性污泥细菌病毒发哮饮食合成纤维所产生，不单单在部位消化道天然屏障中表现效果，况且在平台性的水平上也表现关键因素效果。之中，丁酸是最丰富多样的短链脂肪酸多酸，兼具消除炎症和免疫系统调节效果,本探索刍议丁酸对CaOx肾结石的效果试述潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院专家泌尿五官科吴忠先生、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了互联网药剂学学提供服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文名字大全：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 合作方行业：华山醫院 研究方案项目：大鼠、HK-2神经细胞 组群相关信息：對照组（Con）、类别组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱作为技术性：wifi网络临床药理学探测

理念步奏图

的研究但是

研发工作人员第一个搭配大鼠对整治，实现生理学生物化学指标值和组织结构病理学学染料等研发伎俩察觉丁酸能减低CaOx对整治大鼠肾CaOx硫化锌的形成了和受伤，缓解CaOx对整治大鼠的疾病受伤和脱色杂质的太过形容。与此同时，丁酸还可阻止草酸成脂的HK-2组织受伤、脱色应激状态和组织凋亡。 为实验性学习丁酸机构和靶染色体网路，实验技术人员从PubChem获利丁酸和丁酸酯的二维和3d机构（图1A）。确定PharmMapper参数显示库和Uniprot参数显示库处置后共挑选出11八个丁酸靶染色体供进十步确定概述。将染色体全部导成STRING参数显示库，确定PPI网路确定概述。Cytoscape明确了排名的前20的交通核心区靶染色体的详细浅析网路图，包含CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这部分交通核心区染色体与网路中的另一个染色体均表面出很大的关于性，描述这部分染色体能够充分利用着联合能力。GO和KEGG确定概述折射出了丁酸交通核心区染色体的关于条件和微生态学基本功能（图1C）。交通核心区染色体关键与类固醇缴素初次回复、空气氧化不起效应应激状态性初次回复、亲水性氧上皮细胞对类固醇缴素激励的发生效应及对酸碱性化学有机物有机物的发生效应相关的。上述讲到所讲，这部分交通核心区染色体关键参与进来了空气氧化不起效应应激状态性和对亲水性氧的微动物发生效应过程中 ，是肾结石型成共识机制中尤其极为重要的性的条件，这认为丁酸能够在肾结石中充分利用极为重要性能力。

图1| 丁酸机构与靶染色体网数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进几步挑战丁酸对CaOx肾结石肯定切靶人类什么是表观遗传，探索技术工人利于GEO参数源库对GSE73680中安全健康差表与CaOx肾结石患有的人类什么是表观遗传性别差异来了探索。差表组与CaOx结石患有的取得性性别差异把你想表述出来爱人类什么是表观遗传（DEGs）表观遗传检测基准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个人类什么是表观遗传情况取得发生变化，这里面3379个（89.4%）人类什么是表观遗传把你想表述出来爱调涨，404个（10.6%）人类什么是表观遗传把你想表述出来爱调低（图2A）。对DEGs来聚类算法探讨探讨，热图界面显示了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类算法探讨表现（图2B）。最后，探索技术工人采用GeneCards参数源库人工客服电话技术鉴定了370个会与CaOx肾结石有关系的人类什么是表观遗传，要素词排名前20位的分析人类什么是表观遗传及有关系性评分系统就像文中2C如下。为着发现丁酸改善CaOx肾结石的要素靶点，探索技术工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系人类什么是表观遗传治疗得出没事个Venn图。最后，CYP2C9被肯定为丁酸会影响CaOx肾结石的不确定靶点(图2D)。显然，探索技术工人还来了丁酸与CYP2C9的原子交接，CYP2C9的两个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此效用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在应用电脑网络药理学学预侧CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶表观遗传后，学习人工还实现组织實驗灵魂存在了CYP2C9可减少草酸帮助的HK-2组织的ROS横向、炎症病变受损和凋亡。

图2| 大多数据库结合分享精准预测CYP2C9是丁酸用于CaOx肾结石的靶遗传基因

研究分析导致

本设计前提是认为丁酸在休外和体内的均能可控制CaOx肾结石建模的防氧化的应激状态性和支原体感染病变板材损害，之后凭借系统临床药理学学淘汰获取丁酸危害CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9，第三凭借组织血细胞实验设计灵魂存在CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2组织血细胞ROS横向、支原体感染病变板材损害和凋亡。许多认为认为丁酸将会凭借可控制CYP2C9来可控制CaOx肾结石的防氧化的应激状态性，可减轻支原体感染病变板材损害。这一种流程中拜谱动物体带来了了系统临床药理学学技術功能，凡此种种拜谱动物体可增进熟进一步完善的表观遗传组学、蛋清质组学、新陈代谢组学等多个学物料及技術功能，诚邀详询询问！ 参考使用文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.