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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

老是用作纸业塑料原材料而被掌握的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解代谢固体废物”变成“寻宝小碳原子”的苦不堪言之路类同,知道近十多年才被发现其注重的海洋生态学功用,终是“起身农奴把合唱”,很大是在免疫细胞细菌感染性消化道传染疾患理论研究这个领域内异彩纷呈。原有篇文章报道怎么写了在种种细菌感染性消化道传染疾患的绿色实体模型中予以衣康酸或其化学上呈现衍海洋生物的控制益处,消息队列现其暗藏靶点。关羽衣康酸的“上一世”与“今身”,详细文章《乳酸的奋斗史哥们——衣康酸!这篇带你飞了解一下衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化装饰蛋白质组学产品,实现1000+深奥度遮盖位点验出,安稳逆转经典英文靶点,全定位生信了解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“校验”全工作流程服務,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验性过程

02、评测大数据

03、经“点”初现

在监测数据分析中,检测出二个资料中通讯稿的著名靶点甚至衣康酸突显位点,如第1个个被表明的衣康酸共价突显球球蛋清KEAP1,还会有糖酵解环路中的3个要素因素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,甚至炎性小体主成球球蛋清NLRP3和受损细胞病变历程中的要素因素球球蛋清RIPK3等,其质谱图正确图如下图所示。

04、產品共同点

1.几吨质控

商务化特男人测试探针孵育、SDS-PAGE查重、WB查验、子样本有关性概述等多方面位查重,保持创业项目成果信得过性。

2.高功效质谱仪器设备网络平台

在Orbitrap Astral全新几代高分别质谱仪六道金刚咒下,体现衣康碱化装饰位点及血清亲子鉴定新深浅,助推器实验探究新会发现。

3.全操作流程一坐式服務

依据拜谱生物技术加强的科学试验网上平台,可提高“细胞膜培养教育→验测器孵育→WB验测→玄妙度衣康碱化绘制验测→专业生信数据分析→某一位点PRM查证”全步骤精准服务,省时杠杆原理更更省心。

05、定性分析的内容(大部分)

06、应该用方向上

PART 2、文献资料分享一下

医学文献一

日文宝贝标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探究玩法:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

英语怎么说题头:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语主题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究分析项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例子随之出现方法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13拥有比较强的底物紧密联系特性,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康硝化作用体现组测试数据显示中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应绘制(下列图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

看作TCA间歇中的中部分解分泌物,衣康酸调试分解分泌、免疫抗体系统系统和宫颈宫颈炎症区间内的彼此直接影响,为治療免疫抗体系统系统宫颈宫颈炎症性病毒供给了替换治療策咯。衣康酸成分中的亲电性α,β-不过饱和羧酸成分能对血清质上的可溶性半胱氨酸残基做出烷基化突显(迈克尔暴击伤害表现),这样译为后突显被称作“衣康酸突显(itaconation)”,而使直接影响血清质效果,政策调控免疫抗体系统系统回复和分解分泌路径,为种病毒类药产品研发供给新总体目标。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化掩盖球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学肯定化学发光法靶向药物代谢转化组(QMT1000)或能量场代谢率率靶点代谢率率组的产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参照期刊论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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